Mục đích
Hướng dẫn cách chuẩn bị các ống chứa môi trường bảo quản và vận chuyển mẫu bệnh phẩm để xét nghiệm phát hiện SARS-CoV-2 bằng kỹ thuật Real-Time RT-PCR.
Phạm vi áp dụng
Áp dụng tại các bệnh viện, cơ sở y tế có phòng xét nghiệm thực hiện xét nghiệm sàng lọc, khẳng định SARS-CoV-2 bằng kỹ thuật Real-time RT-PCR. Căn cứ diễn biến của dịch bệnh COVID-19 hoặc khi không có đủ ống môi trường thương mại, lãnh đạo đơn vị xem xét áp dụng việc tự chuẩn bị ống chứa môi trường phục vụ xét nghiệm SARS-CoV-2.
Trách nhiệm
Các nhân viên khoa/ phòng xét nghiệm, chuẩn bị ống môi trường vận chuyển vô trùng tại phòng xét nghiệm tuân thủ hướng dẫn này.
Trưởng/phụ trách khoa/phòng xét nghiệm chịu trách nhiệm thực hiện và giám sát thực hiện.
Giải thích từ ngữ và chữ viết tắt
Môi trường vận chuyển mẫu bệnh phẩm (vi rút) là ống chứa dung dịch có tác dụng bảo quản vi rút trong quá trình vận chuyển.
Trong Hướng dẫn này môi trường vận chuyển bao gồm các loại sau và được gọi chung là môi trường vận chuyển:
Nước muối sinh lý là hỗn hợp giữa nước và natri clorua được pha chế với tỷ lệ 0,9% (NaCl 0,9%)
Nước muối sinh lý có chứa dung dịch đệm phosphate;
Môi trường vận chuyển là các sản phẩm thương mại đã được pha chế thành bán thành phẩm hoặc thành phẩm (tham khảo thành phần của môi trường tại Phụ lục 2).
Thiết bị, dụng cụ và nguyên vật liệu
Tủ an toàn sinh học cấp 2 hoặc tủ sạch (bảo vệ cho các thao tác trong tủ)
Pipette vô trùng có thể tích 10 mL -25 mL
Pipette aid hoặc quả bóp
Ống nhựa hình chóp vô trùng có nắp đậy kín, có thể tích 15 mL (ví dụ:
ống Falcon)
Nhãn dán thông tin trên ống nhựa
Nước muối sinh lý vô trùng (natri clorua 0,9%) đã được pha sẵn dùng trong tiêm, truyền và đạt tiêu chuẩn chất lượng (không dùng nước muối sinh lý tự pha bởi các phòng xét nghiệm).
Môi trường vận chuyển loại khác (nếu sử dụng môi trường vận chuyển mẫu bệnh phẩm (vi rút) là các sản phẩm thương mại nếu có).
An toàn
Tuân thủ theo quy định, quy trình an toàn của phòng xét nghiệm.
Nội dung thực hiện (đối với môi trường vận chuyển là natri clorua 0,9% vô trùng).
Chuẩn bị dụng cụ:
Lấy một số lượng ống nhựa vô trùng (loại ống Falcon 15 ml hoặc tương đương) đã được tính toán và ghi nhãn trên ống các thông tin sau:
Tên dung dịch bảo quản mẫu;
Số lô;
Ngày pha;
Ngày hết hạn;
Nhiệt độ bảo quản.
Chuẩn bị các chai natri clorua 0,9% vô trùng
Chuẩn bị pipette vô trùng, pipette aid/quả bóp
Vệ sinh tủ an toàn sinh học cấp 2 hoặc tủ sạch theo quy trình tại phòng xét nghiệm
Các bước tiến hành
Làm lỏng nắp chai natri clorua 0,9% (không mở hẳn nắp chai cho đến khi hút hết và phân chia đều vào các ống nhựa vô trùng)
Sử dụng pipett vô trùng hút dung dịch natri clorua 0,9% và cho vào mỗi ống nhựa vô trùng 2-3 mL natri clorua 0,9% .
Đậy nắp ống nhựa vô trùng
Tiếp tục thao tác cho đến khi hết số ống đã chuẩn bị
Ghi các thông tin vào Biểu mẫu chuẩn bị môi trường vận chuyển mẫu của phòng xét nghiệm.
Bảo quản ở nhiệt độ phòng, sử dụng trong vòng 48 giờ hoặc 2-8 độ C dùng trong vòng 6 tháng.
Thực hiện kiểm tra vô trùng
Lấy số lượng ống đã chứa dung dịch bảo quản và vận chuyển mẫu (số lượng được tính theo hướng dẫn tại Phụ lục 1) ủ ấm ở nhiệt độ 36°C ±1°C.
Sau 18-24 giờ lấy các ống ra khỏi tủ ấm để kiểm tra vô trùng
Ghi chép lại kết quả vào sổ/Biểu mẫu
Nếu không thấy vi sinh vật mọc trong ống thì đạt về vô trùng.
Nếu có vi sinh vật mọc trên trong ống môi trường (ống đục) thì bỏ toàn bộ lô ống môi trường đó, kiểm tra nguyên nhân và khắc phục cho các lần sau.
(Lưu ý: đối với môi trường vận chuyển loại khác, phòng xét nghiệm áp dụng theo quy trình tương tự và theo hướng dẫn của nhà sản xuất).
Tài liệu tham khảo
Cục Thực phẩm Hoa Kỳ (FDA), 2020, Phần trả lời các câu hỏi liên quan đến môi trường vận chuyển mẫu bệnh phẩm cho xét nghiệm SARS-CoV-2 https://www.fda.gov/medical-devices/coronavirus-covid-19-and-medical- devices/faqs-viral-transport-media-during-covid-19#procodes
Tổ chức Y tế thế giới (WHO), 3/2020, hướng dẫn tạm thời về xét nghiệm COVID-19, tr. 5. https://www.who.int/publications/i/item/10665- 331501
Trung tâm Dự phòng và Kiểm soát Dịch Bệnh Hoa Kỳ (CDC), 2020,
Hướng dẫn tạm thời của về lấy mẫu, xử lý và xét nghiệm SARS-CoV-2; https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/lab/guidelines-clinicalspecimens.html
Viện tiêu chuẩn phòng xét nghiệm lâm sàng (CLSI Standard), M40-A2. Quality Control of Microbiological Transport Systems; Approved Standard, second edition.
Evaluation of saline, phosphate buffered saline and minimum 1 essential medium as potential 2 alternatives to viral transport media for SARS-CoV-2 testing; http://jcm.asm.org.
Phụ lục 1
Bảng bảng tính số lượng ống môi trường cần kiểm tra vô trùng sau mỗi lô/mẻ pha
|
Số ống môi trường /mẻ, lô |
Số lượng ống tối thiểu cần kiểm tra cho mỗi mẻ |
|
≤ 100 ống |
10% hoặc 4 ống (nếu số lượng ống tính từ 10% lớn 4 thì chọn số lượng đó) |
|
101 |
10 ống |
|
≥ 500 ống |
2% hoặc 20 ống (nếu số lượng ống tính từ 20% nhỏ hơn 20 ống thì chọn số lượng đó) |
Phụ lục 2
Tham khảo về thành phần của môi trường vận chuyển vi rút
Ví dụ 1: Môi trường vận chuyển vi rút (Viral Transport Medium (VTM))
Dung dịch Hanks Balanced Salt Solution (HBSS) 1X với ion calcium và magnesium, không có chứa phenol đỏ, 500mL/chai (hoặc HBSS có chứa phenol đỏ như là chất chỉ thị pH)
Fetal bovine serum (FBS) vô trùng, mất hoạt bằng nhiệt
Gentamicin sulfate (50mg/mL) (hoặc chất kháng sinh tương tự với nồng độ thích hợp để ngăn ngừa sự tạp nhiễm và sự phát triển của vi khuẩn)
Amphotericin B (250μg/mL) (Fungizone) (hoặc kháng nấm tương tự với với nồng độ thích hợp để ngăn ngừa sự tạp nhiễm và sự phát triển của nấm)
Ví dụ 2: Môi trường vận chuyển vi rút (Viral Transport Medium (VTM)
DMEM (Dulbecco’s Modified Eagle Medium)
BSA (Bovine albumin faction 7.5%)
Kanamycine sulphate
Ciproflosaxin hydrochloric
NaHCO3
Hepes
Ampociline B hoặc Penicilin-Streptomycin pH: 7,2
Ví dụ 3: Môi trường Amies lỏng không có chứa charcoal
Sodium chloride
Calcium chloride
Potassium chloride
Magnesium chloride
Monopotassium phosphate
Disodium phosphate
Sodium thioglycollate
Demineralized Water
pH (tại 25oC 7.3 + 0.2 )
